1、挂牌成本不同：挂牌成本基本包括中介机构的费用和挂牌收取的费用。新三板挂牌成本在160万左右，不同区域性股权市场的费用不同，大体成本在70万左右。其中前海股权交易中心新四板直通车服务(包括挂牌、融资辅导、融资对接)仅6万元。

2、融资功能不同：新三板主要为挂牌企业提供股权融资，新四板主要为企业提供挂牌、登记、托管、转让、展示服务以及各类股权、债权、金融产品等服务。

市场活跃程度不同：新三板为非上市公众公司，股东人数可以超过200人。新四板为非公众股份公司，股东人数在2-200人。

股价形成机制不同：新三板挂牌企业依据股票交易形成价!格，区域性股权交易中心挂牌企业根据公司净资产确定股价。